種子島・屋久島などの薩南諸島の北部文化圏、奄美諸島および琉球諸島からなる中部文化圏、宮古・八重山諸島の南部文化圏です。
奄美・沖縄諸島からなる中部文化圏は、九州の縄文文化が縄文前期ごろに北部文化圏を南下して定着し、独自の発展をとげたもので、その発祥は、近年の遺跡の発掘によると、従来より数千年も古くさかのぼることが証明されました。
いっぽう、南部文化圏とみなされる先島（さきしま・宮古および八重山諸島）の文化圏は、日本の縄文・弥生文化とは異質です。日本本土や奄美・沖縄諸島との関わりはほとんどなく、台湾やフィリピンなどの南方諸島との関わりが深いことから、南方一帯にそのルーツがあると考えられています。
