沖縄の食生活を支えてきた漁業も、かつおやまぐろ等の沖合漁業をはじめ、栽培・養殖技術の研究開発による、作り育てる漁業も推進されている。また、漁船の大型化や流通体制の整備、加工業の育成強化のために県下８６港が漁港指定され、年々その整備が行われている。